从免疫学方面分析，蓝耳病病毒存在以下四个特征，从而，给蓝耳病的免疫带来很大的影响和不确定性，进而，也带来了很大的争议性。

　　1、蓝耳病的变异。蓝耳病的变异快，并且不同的毒株之间能够产生基因重组，形成新的病毒。最新的研究证明，在猪场最早能在免疫弱毒苗后5天，检测到新的重组病毒；一个猪场能检测到5个不同的毒株。所以一个猪不能够免疫多个不同毒株的疫苗。

　　2、抗体依赖增强作用（ADE）：蓝耳病病毒在机体有一定的抗体（该抗体浓度不足以抵制蓝耳病病毒的繁殖）情况下，反而能在机体内快速繁殖。这就解释了为会么有的猪场不免疫蓝耳病不出问题，一免疫反而出现问题的现象。所以猪场在免疫蓝耳病疫苗之前，一定要对猪场的蓝耳病感染情况有一定的了解，或者使用泰万菌素等药物稳定蓝耳病。

　　3、蓝耳病的免疫空白期长。蓝耳病弱毒苗免疫后，中和抗体的产生在四周以后，干扰素的产生更慢。而蓝耳的感染，消除病毒血靠中和抗体，消除持续感染靠干扰素。也就是说，疫苗免疫后大约一月才能有好的保护作用，在这之前为免疫空白期。在空白期内，如果有感染或其它影响免疫力的因素干扰，可能导致免疫失败。

　　4、持续感染。中和抗体只能消除病毒血症，蓝耳病病毒还在淋巴组织等部位持续感染。这也为蓝耳病毒的变异和重组创造了条件。