PRRS于1995年首次在中国报道，郭伯琦等人1996年分离到一株prrsv并命名为CH-1a（Genbank ID：AY032626）；杨慧慧等人 1997年分离到prrsv菌株并命名为BJ-4（Genbank ID：AF331831），两者均属于PRRSV-2血清型 。血清学研究表明，中国东部和北部的阳性血清百分比超过40％，这意味着PRRSV在1995年之前就已经在中国流通。目前尚不清楚PRRSV是如何传入中国的，但多个证据表明prrsv通过进口种猪传入中国，如 （1）有学者2006年成功从加拿大进口的种猪中分离到PRRSV毒株。（2）BJ-4与VR2332的基因组同源性约为99.6％，CH-1a与JA142（Genbank ID：AY424271）的基因组同源性约为94.5％，说明两者（特别是BJ-4）与北美分离株都密切相关。1995-2006年在中国主要流行这两个毒株。

在2006年夏天，高致病性PRRSV（HP-PRRSV），引起非典型的PRRS，并对养猪业造成毁灭性的破坏。新的PRRSV变异株在Nsp2基因中显示出独特的不连续的30个氨基酸（482aa，534-562aa）缺失。代表性毒株是JXA1（Genbank ID：EF112445），TJ（Genbank ID：EU860248）和HuN4（Genbank ID：EF635006）。

2013年以来，在常规临床调查中PRRSV感染明显增多，并出现了NADC30样毒株，这主要是由于进口生猪携带的prrsv跟国内毒株发生重组所产生的。目前，HP-PRRSV样株和NADC30样株主要在田间循环，临床检出率较高。

二、流行于中国的PRRSV-2的分类情况

基于全球PRRSV分类系统和GenBank中的ORF5序列信息，研究者选择了127个PRRSV-2 ORF5序列进行分析，其中包括9个参考株和118个流行株，将我国普遍存在的PRRSV-2株分为四大系：谱系1，谱系3，谱系5（谱系5.1）和谱系8（谱系8.7）。

谱系1

自2013年以来，中国已报道了谱系1，也称为NADC30样菌株。目前在我国东北、东南、中东与东南等九个省区发生疫情。河南省临床检出率逐年上升，高达50％，其临床检测率与谱系8.7相当。与中国的其他PRRSV谱系相比，NADC30样菌株显示出更多的重组可能性和致病性多样性。对于毒力差异，一些NADC30样菌株（JL580，FJ1402等）表现出与HP-PRRSV相当的高致病性。NADC30自引进中国以来经历了广泛的突变和重组。特别是与不同的流行毒株之间的基因片段的交换，造成不同的变种，毒株的致病性和抗原性都产生了新的变化。

谱系5（谱系5.1）

谱系5.1在中国很早就出现了，杨慧慧等人 1997年分离到BJ-4。它与VR2332和RespPRRS MLV（Boehringer Ingelheim，Germany）分别显示出99.6％和99.8％的基因组同源性。这表明，谱系5.1有可能从北美进口到中国。虽然早在1996年就出现了谱系5.1，但在中国却始终没有大流行，临床检测率低于10％。

谱系3

在2010年被首次报道，主要集中在中国东南部（江西，福建，广东及广西）。代表菌株有GM2（Genbank ID：JN662424）和QYYZ（Genbank ID：JQ308798）；与VR2332、CH-1a、BJ-4和JXA1的基因组同源性为86.2％〜88.7％。谱系3与以前的流行菌株遗传距离很远，其来源有待进一步研究。谱系3的临床检测率也低于10％。

谱系8（谱系8.7）

根据ORF5序列的系统发育分析，可将子谱系8.7分为5个亚群 - 亚群I〜亚群V。

亚群I是与CH-1a密切相关的PRRSV毒株。CH-1a是中国第一个分离的PRRSV毒株，被公认为经典PRRSV的祖先毒株。

亚群II被认为是经典和HP-PRRSV之间的中间亚群。而BJ0706（Genbank ID：GQ351601）和NB-04（Genbank ID：FJ536165）是代表性的菌株。在Nsp2基因第481位残基处发现1aa缺失，与CH-1a基因同源性为95.1％〜95.8％，与JXA1基因同源性为97.1％〜98％。

亚群III〜V属于HP-PRRSV衍生株或HP-PRRSV疫苗衍生株。HP-PRRSV在2006年导致中国大范围暴发PRRS。代表菌株有JXA1、TJ与HuN4；与CH-1a基因组同源性为95.3％，与BJ-4基因组同源性为89.6％。JXA1-R、TJM-F92和HuN4-F112遗传多样性仍在扩大，并呈现出不同的进化群。

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